Die Internet-Telefonie ist aber auch mit Risiken verbunden, auf die der Bundesbeauftragte für den Datenschutz und die Informationsfreiheit Peter Schaar in einem aktuellen Informationsblatt hinweist. Dies gilt insbesondere für die Vertraulichkeit von Telefonaten, da bei VoIP Gesprächsinhalte meist unverschlüsselt über das Internet übertragen werden.

Eine Verschlüsselung bei VoIP ist zwar grundsätzlich möglich, wird aber kaum angeboten. Hier sind sowohl die Anbieter von VoIP als auch die Hersteller von VoIP-Telefonen gefordert, datenschutzgerechte Lösungen zu finden.